自創(chuàng)刊以來(lái)，先后被列為“中國(guó)科技論文與引文數(shù)據(jù)庫(kù)（CSTPCD）”（1987年）、“中國(guó)科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫(kù)（CSCD）”（1989年）、“中國(guó)學(xué)術(shù)期刊綜合評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)庫(kù)（CAJCED）”（2002）統(tǒng)計(jì)源來(lái)源期刊（均為數(shù)據(jù)庫(kù)創(chuàng)建之年被收錄）。 自1998年中國(guó)科學(xué)技術(shù)信息研究所發(fā)布的首份《中國(guó)科技期刊引證報(bào)告》（核心版）以來(lái)，本刊均被評(píng)選為“中國(guó)科技核心期刊”。1997年的影響因子為0.324，上升至2021年的核心影響因子為1.743，在30本基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)類(lèi)期刊中位列第一。 2004年入選為“中國(guó)科技期刊精品數(shù)據(jù)庫(kù)”。首次榮獲2009年度“百種中國(guó)杰出學(xué)術(shù)期刊”稱(chēng)號(hào)。2010年、2013年、2017年分別遴選為第二、第三、第四屆“中國(guó)精品科技期刊”（2008年為首屆，遴選排名前300的國(guó)內(nèi)期刊）。2014-2017年連續(xù)4年被評(píng)選為“中國(guó)國(guó)際影響力優(yōu)秀期刊”。2011年以來(lái)，均被評(píng)選為“RCCES中國(guó)權(quán)威學(xué)術(shù)期刊（A+）”。 自1992年以中國(guó)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)類(lèi)核心期刊入編《中文核心期刊要目總覽》1992年版（第1版）以來(lái)，至今已連續(xù)入編至2023年版（第10版）。 2023年入選《科技期刊世界影響力指數(shù)（WJCI）報(bào)告》（2023年科技版），已連續(xù)4年。 2022年入選“預(yù)防醫(yī)學(xué)與衛(wèi)生學(xué)高質(zhì)量科技期刊分級(jí)目錄”（2021年版）。 1987年被美國(guó)醫(yī)學(xué)索引Medline檢索數(shù)據(jù)庫(kù)收錄（截止到2017年6月），并先后被Scopus（1987-1995,1998-2016,2021年7月2日被重新收錄）、Embase（1987-1995,1998-2016,2021年被重新收錄）、EBSCO（2014年起）、JSTChina（2007年起）、CABI（2003年起）、Zoological Record（1998年起）、WPRIM（1983年起）、Ulrichsweb (2009年起）、Google Scholar等數(shù)據(jù)庫(kù)收錄。