基因組學與應用生物學最新期刊目錄

十字花科黑腐病菌的tRNA基因是適應性表達而不是組成型表達————作者：龔智宇;胡姍姍;黎宗洋;蘇貝寧;楊玉環;楊卓奇;唐東階;

摘要：傳統觀點認為，一個基因組中所有tRNA基因的表達都是恒定且高水平的，而且不同tRNA基因的表達水平都是相似的，因此屬于組成型表達。而今，隨著挑戰這個觀點的實驗證據不斷涌現，人們越來越意識到tRNA基因的表達可能是適應性表達而不是組成型表達。本研究采用Northern雜交方法，對十字花科黑腐病菌（Xanthomonas campestris pathovar campestris， Xcc）8004...

鱉甲煎丸抑制肝癌細胞的環狀RNA表達譜分析————作者：林洪升;譚金娜;方巧玲;杜柯薇;何佳倩;王運踴;魯曉航;潘愛萍;李明芬;

摘要：本研究主要探討環狀RNA（circular RNA， circRNA）在鱉甲煎丸抑制肝癌進展過程中的表達變化及分子機制。利用find＿circ和CIRI算法、KEGG通路和GSEA富集分析，對circRNA的表達及特征進行深入研究。采用彗星實驗檢測鱉甲煎丸含藥血清對肝癌細胞DNA損傷的影響，并通過β-半乳糖苷酶染色評估其對肝癌細胞衰老的誘導作用以及劃痕實驗用于檢測細胞遷移能力的變化。此外，還構建了...

基于熒光蛋白的植物可變剪切報告系統的構建————作者：唐茜;聶奕;王文慧;陳雨晴;魏濟帆;黃予;陳怡君;劉柯潁;蔡文國;

摘要：內含子剪切是真核生物轉錄后修飾重要環節，是重要的基因表達調控方式。植物中多數基因存在可變剪切，能形成不同的剪切形式。然而對植物可變剪切因子的研究尚待深入。在這個報告系統中，編碼綠色熒光蛋白的基因被插入了一個含有終止密碼子的內含子以中斷熒光蛋白的表達，而當內含子被正常剪切時能表達出綠色熒光蛋白。通過在煙草中進行瞬時表達實驗，該系統可對植物可變剪切的效率進行定性與定量評估。此報告系統的建立為研究剪切輔...

馬立克病毒pUL41宿主互作蛋白的鑒定及調控網絡分析————作者：袁慶楊;馮偉民;黃騰;

摘要：馬立克病毒（Marek's disease virus，MDV）是一種重要的致瘤性皰疹病毒，給養雞業帶來嚴重的疾病負擔。MDV UL41基因產物pUL41是一種獨特的核糖核酸酶，可能參與調節宿主細胞的多種生物學功能，以利于病毒逃避宿主免疫。為了探索MDV pUL41對宿主細胞信號網絡產生的廣泛影響，本研究首先通過免疫沉淀從感染的雞胚成纖維細胞富集與pUL41結合的蛋白，再利用液相色譜串聯質譜技術（...

發根農桿菌介導的金花茶毛狀根活體遺傳轉化體系的建立————作者：黃涵;喇燕菲;岑東燦;徐增富;王翊;

摘要：金花茶(Camellia petelotii)是我國特有的植物資源，具有較高的觀賞價值和藥用價值，建立轉基因體系可為開展金花茶特定基因功能鑒定和金花茶性狀遺傳改良提供基本方法。本研究以金花茶成熟葉片為材料，分別以攜帶紅色熒光蛋白基因DsRed2和發育調節因子GRF5的發根農桿菌(Agrobacterium rhizogenes)進行離體轉化，利用石蠟切片觀察葉柄切口處愈傷組織和毛狀根的細胞形態。結...

基因組學與應用生物學論文撰寫指南

摘要：<正>一、欄目設置本刊設置固定欄目和隨機欄目。固定欄目常設研究論文,發表最新的原始研究成果。隨機欄目根據稿源設述評及其他欄目。二、論文寫作的基本要求1題目與標題論文題目要緊扣主題,務求簡明、新穎,有足夠的信息,能引起讀者的興趣,不用副標題,一般不宜超過25個漢字或英文單詞。應使用標準術語、學名全稱、藥物和化學品通用名稱,不宜使用廣義術語、夸張詞語等,同時避免在題目中使用不常用的縮寫詞

基因組學與應用生物學作者投稿指南

摘要：<正>1刊登范圍本刊主要刊登植物、動物和微生物基因組學、轉錄組學、蛋白質組學和代謝組學等組學,分子醫學、現代生物技術等應用生物學研究的未發表的創新性研究成果,以及上述領域的綜述論文。2欄目設置本刊設置固定欄目和隨機欄目。固定欄目常設研究論文,發表最新的原始研究成果。隨機欄目根據稿源設述評及其他欄目

高粱功能著絲粒的鑒定及序列組成分析————作者：戴妍;周嘉亮;姜鵬;王為;王凱;

摘要：為準確定義高粱(Sorghum bicolor)功能著絲粒并解釋其序列構成，本研究制備了高粱著絲粒特異性組蛋白3變體(centromeric histone H3, CENH3)抗體，并開展了CENH3染色質免疫共沉淀測序(chromatin immunoprecipitation and sequencing, ChIP-seq),通過ChIP-seq數據的基因組回帖，明確了高粱品種‘BTx62...

肉果草屬物種比較轉錄組學分析————作者：陳榮連;李世逢;遲曉峰;

摘要：為了深入挖掘肉果草屬(Lancea)物種全長轉錄組信息，篩選其物種間差異表達基因，本研究對肉果草屬物種進行PacBio Sequel高通量測序，利用生物信息學方法進行基因注釋、結構分析和物種間差異表達基因分析。共獲得肉果草屬全長轉錄組58 392條高質量轉錄本，其中57 690條被NR、 NT、 Pfam、 KOG/COG、 Swiss Prot、 KEGG、 GO數據庫成功注釋；GO數據庫成功注...

結腸癌細胞外泌體circ-SLC38A2靶向miR-10a-5p調控肝星狀細胞LX2活化————作者：張曉靜;李景武;安娜;韓龍才;李青科;盧琳;王昊天;劉艷坤;

摘要：外泌體環狀RNA（circular RNAs，circRNAs）是重塑腫瘤微環境的關鍵調控因子。本研究探討外泌體circRNA通過靶向miR-10a-5p調控LX2活化，重點闡明它們在肝轉移微環境形成中的分子機制。首先，利用生物信息學技術和雙熒光素酶實驗預測并驗證調控miR-10a-5p上游的靶向circRNA；實時定量PCR（Real-time quantitative PCR，RT-qPCR）...

基于蛋白質組學探討芍藥苷抗帕金森病的作用機制————作者：馮真;薛慧銘;金暢;張月;鄭梅竹;

摘要：為闡明芍藥苷抗帕金森病的具體靶點和信號通路，本研究通過MPP⁺誘導損傷的PC12帕金森細胞模型，結合蛋白質組學分析芍藥苷對PC12損傷細胞的保護作用及其潛在靶點和機制。細胞實驗結果表明經芍藥苷處理的細胞組與MPP⁺誘導損傷對照組相比，芍藥苷能顯著提高MPP⁺誘導損傷PC12細胞的存活率，對其有顯著的保護作用，通過蛋白質組學的分析，共...

骨鈣素在考古學研究中的應用————作者：袁夢;凌雪;趙叢蒼;

摘要：骨鈣素是一種由成熟成骨細胞分泌的維生素K依賴性鈣結合蛋白，作為骨骼中含量最多的非膠原蛋白，它被認為是骨形成和骨轉換的重要標志。由于其在骨骼中的高穩定性和低污染風險，骨鈣素在考古學研究中顯示出極大的應用前景。然而，國內對于骨鈣素的考古學研究尚顯不足。本文系統梳理了骨鈣素的生物學特性，闡述了其在考古學領域中判斷個體年齡段和性別、獲取準確的碳氮同位素數據、分析先民的生存壓力和疾病狀況、建立系統發育關系等...

甘蔗莖稈細胞壁力學性能————作者：劉慶庭;張晨琦;林志超;黃瑤;李桃;李志昂;

摘要：細胞是作物承受外力的基本單元，細胞壁是細胞承受外力的基本單元，了解細胞的力學性能首先需要研究細胞壁的力學性能。細胞壁的力學性能可以通過試驗直接測得。目前測試細胞壁彈性模量的方法主要有原子力顯微鏡技術(Peakforce QNM模式)和納米壓痕技術。原子力顯微鏡技術測得的細胞壁各子層彈性模量為精細模量。該測試方法對各子層之間的變化具有高分辨率表征作用，適用于尺寸較小的細胞壁各子層模量表征分析。納米壓...

棉花愈傷組織誘導過程中的DNA甲基化分析————作者：胡蝶;李雪林;梁華;

摘要：為了解棉花(Gossypium spp.)體細胞胚胎發生過程中早期非胚性愈傷組織誘導的表觀遺傳學變化，利用全基因組甲基化測序(whole-genome bisulfite sequencing, WGBS)技術，對陸地棉(Gossypium hirsutum)品系‘YZ1’的下胚軸和非胚性愈傷組織進行DNA測序，并對其甲基化變化進行對比分析。結果表明，在棉花非胚性愈傷組織誘導過程中發生了整體甲基化...

基于BOPPPS模式的遺傳學線上線下混合教學實踐——以“植物雄性不育”教學內容為例————作者：羅繼景;黃婧;岑衛健;

摘要：雖然目前傳統的遺傳學教學已經取得了很多成績，但是仍存在一些不足，比如教學方式方法單一，教學內容單調，學生參與度低等。近年來，現代信息技術的飛速發展和新教學理念的提出進一步推動和促進了教學模式的改革。因此，為深入推進遺傳學的教學改革，本文介紹了基于BOPPPS教學模式，利用在線教學平臺雨課堂開展的遺傳學線上線下混合教學的探索與實踐經驗，并以教學內容“植物雄性不育”為例介紹教學實施的過程。整個教學過程...

植物免疫信號分子NHP結合蛋白的虛擬篩選————作者：黃財;劉詩敏;何聰慧;蔣鋅泉;蘇子惠;楊婧藝;傅瓊;明振華;

摘要：植物代謝產物N-羥基哌啶酸(N-hydroxy-pipecolic acid, NHP)是植物系統獲得性抗性(systemic acquired resistance, SAR)中關鍵的移動信號分子。然而，NHP的受體蛋白及調控其代謝、修飾和運輸的關鍵蛋白仍不明確。本研究針對擬南芥(Arabidopsis thaliana)中受NHP誘導高表達的1 883個基因，通過AlphaFill數據庫篩選具...

PBX1生物學功能研究進展————作者：李雯;王培昌;宋喬;

摘要：前B細胞白血病同源盒轉錄因子1（pre-B-cell leukemia homeobox transcription factor 1， PBX1）是一種進化上高度保守的同源結構域蛋白，在細胞代謝、組織和器官的發育和分化等多個胚胎發育過程中發揮關鍵作用。PBX1作為一種“先鋒轉錄因子”，可以增加染色質可及性，激活并促進骨骼肌分化和乳腺癌增殖相關靶基因的轉錄。PBX1缺失會影響胚胎時期多種器官的正常...

三個促進橡膠樹白粉菌致病的效應蛋白鑒定————作者：左明浩;劉玉涵;殷金瑤;單佳馨;何禮娟;劉文波;繆衛國;李瀟;

摘要：植物病原真菌通過分泌效應蛋白破壞寄主免疫反應，促進其侵染和定殖。白粉菌是專性寄生活體營養型真菌，可以分泌特有的候選分泌效應蛋白(candidate secreted effector proteins， CSEPs)，但這些CSEPs是否促進白粉菌致病仍了解較少。橡膠樹白粉菌(Erysiphe quercicola)可引起橡膠樹白粉病并危害天然橡膠產量。本研究首先對5個具有較高保守性的橡膠樹白粉菌...

犬細小病毒病的組學研究進展————作者：艾馨;王浩榮;張亦凡;謝佳良;于昊;金健佑;田茹萌;馬浩原;高旭;許家翠;

摘要：犬細小病毒病(Canine parvovirus disease, CPVD)是由犬細小病毒(Canine parvovirus, CPV)引起的一種犬(Canis lupus familiaris)的急性、烈性、高致死性傳染病。該病雖有疫苗進行防控，但仍有免疫失敗的案例被報道。CPV的致病機制及宿主的防御機理還未完全闡明。盡管單個基因、蛋白和通路的研究是闡明各種機理的必需研究內容，但各種組學研究...

JCVI:用于比較基因組學分析的多功能工具包————作者：張以星;王爭光;譚月;吳婷婷;齊浥穎;王宇浩;黃育敏;張積森;唐海寶;

摘要：隨著高通量測序技術的快速發展，越來越多物種的基因組組裝、注釋，以及比較基因組學研究得到開展。盡管已有各類工具可以分別處理這些步驟，但用戶對能夠整合這些不同工具的解決方案的需求日益增加。在此，本文介紹了JCVI庫，這是一個功能多樣的基于Python的庫，其模塊化設計能夠處理格式解析、圖形生成、基因組掛載和植物表型提取等多種任務。該庫以BSD-2-Clause許可證發布，用戶可在https://git...

　　基因組學與應用生物學來自網友的投稿評論：

• 奔跑的辣椒醬

  初審1個月，復審不到2個月，都是3個多月給出采用結果，基因組學與應用生物學雜志的論文格式一定要清晰，基本上不會有什么問題。審稿意見都比較正面，也有些無關緊要的問題，給審稿人良好的印象顯然會增加錄用概率。

  2024-08-25 10:15
• Yangming_ak

  該期刊為北大核心、CSCD核心期刊，收稿和審稿速度較快。從今年8.31日投稿到錄用不到2個月的時間，可以反映出該期刊處理稿件效率很高。其次，在審稿過程中，審稿專家專業的點評和主編老師專業的修改要求，使我的論文質量有了很大提升，既有挑戰，更是學習。另外，在修稿過程中編輯部老師非常認真負責，打電話發郵件都能及時回復，并總是耐心地解答所有問題。最后，校稿時主編特別認真地調整了我文章的各種字體、表格以及標點符號。無論是嚴謹專業的態度、專業知識的理解還是言語措辭的功底都令我受益匪淺。總之，期刊處理稿件速度很快，編輯老師認真負責，才使此次投稿非常順利！最后，祝《基因組學與應用生物學》期刊越辦越好！

  2022-11-02 09:27

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